Fixo formado nas escolas de Alvalade, João Matos chegou ao Sporting para integrar a equipa de juvenis, depois de ter dado nas vistas na Selecção de Lisboa, ao serviço do Clube de Carnaxide. Os primeiros tempos de ‘leão’ ao peito não foram fáceis: João Matos sentia que teria dificuldades em afirmar-se não tendo a mesma qualidade técnica de alguns colegas.
Optou por explorar os seus pontos fortes – as características defensivas e a garra em campo – e iniciou um trilho vencedor desde os escalões de formação até aos seniores, onde chegou em 2005/06 e, até hoje, faz parte do lote de capitães.
Fez parte da Selecção Nacional que, em 2018, conquistou o Campeonato da Europa e é uma das figuras mais carismáticas do futsal nacional.